حسین بن روح ناچار بود به شدت تقیه کند. به طوری با مخالفان برخورد می کرد که حتی فکر نمی کردند او شیعه باشد. چه رسد به اینکه وکیل امام عصر(ع) و در راس وکلای امام باشد. ۲۲ سال چنان با تدبیر عمل کرد که دشمن به حساسیت نقش او پی نبرد.
حسين بن روح نوبختي در ۱۸ شعبان سال ۳۲۶ هجري قمري از دنيا رفت. قبر او در محله نوبختيه در بازار عطاران يا شورجه بغداد ميباشد كه هم اكنون زيارتگاه شيعيان مشتاق است.
حضرت مهدی(عج) در نخستین توقیع خود به حسینبن روح نوبختی این چنین مینویسند: به درستی که او نزد ما مکان و منزلت آنچنان بلندی دارد که آن مکان و منزلت او را خوشحال میسازد، خدای تعالی احسان خود را درباره او زیاد فرماید.